在《暗黑者》第一季結(jié)束的時候，有許多秘密漸漸浮出水面----喜歡殺戮，沉湎于正義游戲的Darker竟然是羅飛(郭京飛 飾)當(dāng)年的警校同窗袁志邦，他最終選擇用一場自殺式爆炸來了結(jié)自己的生命。在羅飛和Darker的角逐中，前刑警隊長落網(wǎng)，龐大的商業(yè)集團勢力重組，多年前令全市女孩恐懼的碎尸案真兇逐漸浮出水面。
Darker對生父死亡真相的探尋，牽動了多方命運的變動，也成為他和羅飛斗爭的焦點。十二年前，是什么樣的真相，讓那個充滿正義感的警界奇才，變身成為冷酷的殺手？十二年后，是什么樣的因果，讓新一代的死亡宣判者，無法逃避自己宿命般的責(zé)任？
他們，無一例外地踏上了各自的宿命之路。袁志邦培養(yǎng)的接班人新一代Darker已經(jīng)擁有了超人的能力，并迅速成長起來，他正伺機而動準(zhǔn)備一場新的正義殺戮，而此時羅飛所領(lǐng)導(dǎo)的專案組卻是一盤散沙。前刑警隊長
警界的老領(lǐng)導(dǎo)丁局責(zé)怪追捕韓灝的隊長，未經(jīng)匯報私自行動，他要求把這件案子交由專案組去辦理。梁音(李倩 飾)到醫(yī)院看望受重傷的
尹劍(張瑞涵 飾)覺得是自己才放走了韓灝，心里十分自責(zé)，不想再當(dāng)警察了，在丁局的鼓勵之下，尹劍將前往新的部門工作。阿華毆打折磨韓灝，想讓他和自己合作一起對付Darker，但韓灝拒絕和這股惡勢力合作。羅飛突然接到薛天(梁大維 飾)的短信，約他在天臺見面，羅飛懷疑新Darker就是富家子薛天，他將薛天帶回警局詢問，卻被薛天請來的女律師駁得啞口無言，只好放人。
羅飛和穆劍云(甘露 飾)在咖啡廳里喝咖啡，突然接到電話，薛天失蹤，那個所謂的律師身份也是假的?？Х群韧辏送嫘χ烧l買單，穆劍云突然發(fā)現(xiàn)賬單上赫然放著一張死亡通知單，受刑人為南派三叔，罪行是挖坑不慎。兩人連忙前往南派三叔的住處，在路上，穆劍云通知了所有專案組的成員，通知單出現(xiàn)了，大家馬上響應(yīng)起來，羅飛宣布專案組重新整合！
羅飛和穆劍云來到三叔的住處，三叔將二人放到客廳，就看起自己新寫的小說《老九門》，完全忘記了兩人的存在。羅飛將死亡通知單的事情告訴了三叔，可三叔認(rèn)為這只是書迷的恐嚇而已，對此不屑一顧。出門之后，穆劍云分析，南派三叔精神可能真的有點問題，羅飛告訴穆劍云，其實這個死亡通知單就是惡作劇，是自己假造的，目的只是想了解一下南派三叔是不是真的有精神病而已。
專案組成員聚會，大家都覺得羅飛這次膽子太大了，丁局知道了非處置他不可。羅飛認(rèn)為專案組的每個成員，都各有自己的特色，回到原來的工作崗位只會埋沒才能，只有在專案組才會讓每個人都閃光。得知Darker再次出現(xiàn)，丁局幫專案組人員找了一個新的辦公場所，竟在一艘大型航母的艙體內(nèi)，里面各種設(shè)備一應(yīng)俱全，緊跟潮流，羅飛非常慚愧，告訴丁局通知單是假的，丁局非常生氣，這時，真正的死亡通知單卻再次出現(xiàn)了。
