皇甫謐(陳浩民 飾)回到神針堂，還未把事情告訴香苓(王鷗 飾)之時，梁柳(肖聰 飾)就派人送了一個豬頭前來，讓皇甫謐和香苓看了都尷尬一笑。皇帝確信麗妃(王泫伊 飾)所懷的孩子不是自己的，可因為司馬魁(陳繼銘 飾)手握重兵，他一時半會沒辦法動麗妃，免得兵變危及他的江山社稷，他只能把此事暫時隱忍下來。
皇甫謐將麗妃懷孕兩個月，可能此孕與梁柳有關(guān)的事情告訴香苓，同時跟香苓商量是否進(jìn)宮當(dāng)御醫(yī)主管的事情。香苓覺得，皇甫謐沒有將麗妃懷孕實情說出來，他日真相大白之后，皇帝一定會向皇甫謐問責(zé)，所以她讓皇甫謐還是不要進(jìn)宮較為安全，皇甫謐也同樣覺得他不能進(jìn)宮。
城外瘟疫蔓延，城內(nèi)百姓紛紛跑到神針堂求藥，可神針堂只是醫(yī)館并沒有藥材可賣，百姓們只能圍著神針堂不肯離開?；矢χk前來解圍，在聽取了眾百姓的描述之后，讓他們回去按照自己的辦法消毒，不要因為疫情還沒有蔓延到城內(nèi)就制造恐慌。
皇帝頭疼瘟疫之事，把此事交給司馬魁去處理，讓司馬魁想辦法將疫情解除，可沒想到司馬魁選擇的方法卻是將感染疫情的人全部掩埋掉。皇甫謐前往城外查看疫情，正好看到司馬魁掩埋尸體，其中還有春生的奶奶，而春生奶奶還有一口氣并沒有死，皇甫謐于是偷偷把春生奶奶帶回神針堂醫(yī)治。
皇甫謐給春生奶奶施針之后，讓大師兄抓藥給春生奶奶治病，而他則直接進(jìn)宮找皇帝說明疫情的蔓延情況。皇甫謐請命要去城外解決疫情，皇帝卻認(rèn)為皇甫謐是在危言聳聽，因為他已經(jīng)派人了解了情況，認(rèn)為疫情已經(jīng)受到了控制，所以他不準(zhǔn)皇甫謐的請求。
皇帝看皇甫謐非常堅持，便逼迫皇甫謐做選擇，讓皇甫謐答應(yīng)當(dāng)御醫(yī)主管，他便準(zhǔn)許皇甫謐出城治病。皇甫謐不敢把司馬魁做的事情直接告訴皇帝，可他又不肯當(dāng)御醫(yī)主管，只能再次惹怒皇帝，抗旨不遵。梁柳得知皇甫謐再次得罪皇帝，心里特別的開心，于是命高升將百姓所需的消毒藥材全部提高五倍的價格，同時去向司馬魁報告這個好消息。
司馬魁得知皇帝不相信皇甫謐的話，相信他處理好了疫區(qū)的事情，于是跟梁柳商量著，如何借此次的疫情，將皇甫謐置于死地。布準(zhǔn)(樊少皇 飾)和香苓都認(rèn)為，救城外的百姓要緊，讓皇甫謐同意進(jìn)宮當(dāng)官，得到皇帝的允許出城治病，可皇甫謐卻還是猶豫不決。
梁柳想讓皇甫謐進(jìn)退兩難，主動去向皇甫謐示好，想讓皇甫謐跟他一起去治瘟疫，好讓皇甫謐死在疫區(qū)回不來。皇甫謐對梁柳的突然轉(zhuǎn)性半信半疑，聽到梁柳愿意幫他到皇帝面前求情，他這才答應(yīng)跟梁柳合作一起去疫區(qū)治病，然后把自己親自寫的信轉(zhuǎn)交給梁柳遞呈給皇帝。
梁柳給皇甫謐送了一批珍貴的藥材，皇甫謐于是讓人把藥材拿到草春堂，更換治瘟疫的藥材。梁柳和司馬魁表面上向皇帝求情，幫皇甫謐申請去疫區(qū)，實則添油加醋惹怒了皇帝，氣得皇帝直接下令封了神針堂?；矢χk還未把藥材配好送到疫區(qū)，就得知神針堂被封，讓他很是郁悶，而梁柳則在此時前來神針堂，再次添油加醋，想讓皇甫謐再抗旨逃出神針堂去。
皇帝見到奏折得知瘟疫還沒有得到控制，逼問前去幫他查看的李明全，才得知李明全并沒有查看清楚，于是命王贊前往疫區(qū)調(diào)查。皇甫謐因為不能去疫區(qū)治病，在神針堂內(nèi)喝酒買醉，所有人勸他都勸不了，這時嵇康前來罵了皇甫謐一頓，將他給罵醒了。
皇甫謐被罵醒之后，便寫信向皇帝認(rèn)錯，同意進(jìn)宮當(dāng)官，皇帝這才開心地解封，同意皇甫謐去疫區(qū)緩解疫情。
